作為政府職能轉移的有效載體，學會承擔了多項政府職能。一是承擔了國家隊運動營養食品的集中采購管理工作，為56個國家隊采購共計1.8億元的安全、有效的運動營養食品；二是承擔了奧運會科學大會和亞運會科學大會的組團工作，組織國內體育專家學者參加了悉尼、雅典、北京和倫敦奧運會科學大會，以及釜山、多哈、廣州和仁川亞運會科學大會；三是承擔了體育科技統計與成果登記工作，共登記應用基礎研究和奧運科研攻關服務課題成果約1500多項，涉及1500余人，200多個單位；四是承擔了國家科技進步獎的組織評選和推薦工作，迄今為止在160項優秀科技成果中推薦出參評項目20項，其中4項榮獲國家科技進步二等獎；五是承擔了體育科技專著、譯著資助出版工作，組織翻譯了國外體育科技圖書16本，資助出版了科技、科普著作16本，為競技體育和群眾體育發展提供科學指導；六是承擔了“十二五”國家科技支撐計劃項目和國家體育總局重點研究項目的課題驗收工作，為30余項課題通過結題驗收提供組織保障。